Strand NGS 3.4 Windows/Linux/macOS

در تاریخ: 1398/09/09 8:02:38

توضیحات

Strand NGS ، نام نرم افزار مهندسی و تخصصی در زمینه تجزیه و تحلیل پیشرفته داده های تولید شده توسط پلت فرم NGS می باشد. در حقیقت شما به کمک این بسته نرم افزاری می تواند تجزیه و تحلیل ، مدیریت و تجسم های خود را به وسیله‌ی این محصول انجام بدهید. این نرم افزار همچنین با توجه به پشتیبانی از جریان های کاری نظیر DNA-Seq ، ChIP-Seq ، Methyl-Seq ، MeDIP-Seq و آزمایش های RNA-Seq کوچک می تواند پاسخگو تمام نیاز های شما باشد. این نرم افزار همچنین امکان وارد کردن پرونده های SAM و BAM را ممکن کرده است.

همچنین سازندگان نرم افزار Strand NGS به لطف پلت فرم Avadis و استفاده از الگوریتم های مدرن جهت تجزیه و تحلیل و شبیه سازی داده های پیشرفته را به خوبی به ارمغان آورده است. از طرفی این محصول به کمک ابزار های کمکی خود نظیر Illumina ، Ion Torrent ، PacBio ، Roche و ABI SOLiD می تواند تجزیه و تحلیل های شما را دقیق تر بررسی نماید. از دیگر قابلیت های این محصول می توان به امکان پیدا کردن SNP ها و تجزیه و تحلیل تاثیر آن اشاره داشت.

رابط کاربری مناسب و یکپارچه از مزایای استفاده از این محصول مهندسی و تخصصی به شمار می رود. مادامی که شما از این نرم افزار استفاده کنید، با انبوهی از داده ها و آمار های مختلف حاصل شده از تجزیه و تحلیل ها روبرو خواهید شد. خوبی استفاده از این محصول مربوط به نحوه ارائه داده ها در یک محیط کاملا مناسب و منظم می باشد.

امکانات و ویژگی های نرم افزار Strand NGS :

امکان تجزیه و تحلیل ChIP-Seq ، RNA-Seq و DNA-Seq
قابلیت وارد کردن پرونده های SAM و BAM و امکان پیدا کردن SNP ها
تجزیه و تحلیل تاثیر SNP ها بر روی نسخه رونوشت
امکان شناسایی متغیرهای ساختاری (درج ها ، حذف ها ، جابجایی ها ، وارونگی ها)
قابلیت تعیین سطح ژن ها و شناسایی آن ها
امکان شناسایی انواع و اقسام Exon ها و اتصالات Novel Splice
و…

سیستم مورد نیاز

Strand NGS is supported on 64-bit Windows, Mac OS X, and Linux platforms. The specific versions supported for each platform are as follows

Windows – Windows 7, Windows 8, Windows 10 and Windows 11

Linux – The tool should work on any flavour of Linux, but has been tested on Red Hat Enterprise Linux (up to v6.5), Debian GNU/Linux up to 9.0 (Stretch) and Ubuntu up to 18.04 LTS (Bionic Beaver)

Mac OS X – Up to Mac OS 10.13 (High Sierra)

The architectures supported in all the cases above include 64-bit x86-64 compatible architectures. Intel Itanium (IA-64), Mac Power PC (PPC), Sun SPARC, IBM POWER and other such architectures are not supported.